Entidade isenta ao PIS mas tributa COFINS

Boa tarde,

A empresa em que trabalho é isenta de PIS, porém tributamos a COFINS sobre os serviços prestados.

Ao simular a emissão manual de uma NFS-e no emissor nacional, identifiquei que não há um regime de isenção específico para o PIS, nem a opção de informar alíquota zero. Alguém está enfrentando a mesma situação?

Entrei em contato com a prefeitura, que me orientou a procurar o suporte do emissor nacional. No entanto, ao enviar um e-mail para atendimento.nfs-e@rfb.gov.br, fui informado de que deveria entrar em contato com a prefeitura.

Agradeço qualquer orientação ou experiência que possam compartilhar.